Fonksiyonel Tıp  yaklaşımında amaç kişinin hastalığına tanı koyarak  semptomları tedavi etmeye çalışmak değil, bu hastalık ya da şikayeti oluşturan hazırlayıcı mekanizmaları   tespit ederek hastalığın   kök sebeplerini  tedavi  etmektir.
Özellikle yıllardır kalıcı olarak iyileşme  sağlanamayan  kronik hastalıklarda kök sebepleri bularak çözüm sağlanabilir.
Fonksiyonel Tıp  yaklaşımında bağışıklık sistemi, detoksifikasyon sistemi,hormonal ve endokrin sistem, sindirim sistemi , kardiyovasküler sistem , mitokondriyal enerji sistemi ve ruhsal sistem ayrıntılı olarak değerlendirilir.  
Hastalığı tetikleyen ruhsal kök nedenle beraber vücutta işleyişi bozulan sistemler birlikte ele alınarak gerekli vitamin mineral destekleri, mikrobiyota  desteği ,  beslenmenin düzenlenmesi,fito besinler  ve  stres  yönetimine yönelik desteklerle yeni bir yaşam şekli oluşturulur.

Amaç şikayetleri tedavi etmek değil, her hastanın kendine ait bireysel özellikler taşıdığı ve birbirinden çok farklı çevresel, metabolik ve psikolojik mekanizmaların bir harmanı olduğunu görebilmektir.Bu nedenle çok detaylı bir anamnez (yaşam öyküsü) alınması gerekir. Bu yaşam öyküsünde doğduğu andan itibaren tüm yaşam tarzı, beslenme alışkanlıkları,  genetik yatkınlığı ve çevresel özellikleri, iş ve aile ortamı, toksik maruziyetleri, yaşadığı travma ve yaşamındaki stres faktörleri teker teker ele alınır.Fonksiyonel tıp yaklaşımında merkezde hastalık ve tanı  değil hasta vardır.
Bu yaklaşım  hastalığı çözmek için  bakış açısının değiştirilmesini amaçlar.

Fonksiyonel tıp yaklaşımında bireysel farklılıklar  söz konusu olduğu gibi bir çok verinin değerlendirileceği  rutin kullanılan klasik laboratuvar testlerine ihtiyaç duyulur.

Fonksiyonel tıp yaklaşımında;
Her bireyin kendine ait genetik ve çevresel faktörlere göre değişebilen biyokimyasal değerleri vardır.
Kişinin beden ,ruh ve zihin sağlığı için gerekli  olan mekanizmaların düzenlenmesi ve dengenin sağlanması önemlidir.
Fonksiyonel tıp organı değil organizmayı tedavi etmeyi amaçlar.
Fonksiyonel tıp sağlığı  korumaya ve geri kazanmaya yöneliktir.